A las pocas horas de ser elegido vicepresidente de la Conferencia Episcopal Española, monseñor Fernando Sebastián participó en la presentación del libro Los orígenes de la pretensión cristiana (Ediciones Encuentro, Madrid, 2001) obra del fundador de Comunión y Liberación, monseñor Luigi Giussani. En el acto también participó el coordinador de Estudios y Programas del Partido Popular, Eugenio Nasarre. Monseñor Sebastián comenzó su intervención asegurando que "el problema de la Iglesia de España no es que la gente esté sin bautizar sino que no cree en el significado del bautismo. Por eso es importante el libro de monseñor Giussani para la evangelización, porque marca un itinerario de fe". El recién elegido vicepresidente de la Conferencia episcopal añadió: "Nuestra pastoral tiene una debilidad fundamental: da por supuesto que Dios es Alguien para la gente, que Dios es importante. Y no es así. Nuestros cristianos y nuestros sacerdotes no saben hablar de Dios porque en España llevamos siglos sin hablar de Dios. Nunca en la historia, como ahora, se ha hecho tan necesario reconstruir el latido religioso del hombre".